南京大学与台港澳高校合作协议一览
1993年至2020年，南京大学已经与台港澳地区45所大学、研究机构、基金会等签署校际合作协议，其中台湾地区35所，香港地区8所，澳门地区2所。
| 台湾地区合作院校（35所） |
| 序号 | 院校 | 合作信息 | 学生/教师交换 |
| 1 | 台湾大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 院系级合作协议 | 政府管理学院：本科生/研究生 每学年2人，免学费 |
| 2 | 台湾中央大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 3 | 成功大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 4 | 淡江大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 5 | 东海大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 6 | 东华大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 7 | 东吴大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 8 | 逢甲大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 9 | 佛光大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 10 | 辅仁大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期2人，免学费 |
| 11 | 金门大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期10人，免学费 |
| 12 | 静宜大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 13 | 明道大学 | 校级合作协议 | 学术合作 |
| 14 | 铭传大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 15 | 南华大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 16 | 世新大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 17 | 台北大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 18 | 台北教育大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期2人，免学费 |
| 19 | 台湾科技大学 | 校级合作协议 | 学术合作 |
| 20 | 台湾师范大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期2人，免学费 |
| 21 | 台湾艺术大学 | 校级合作协议 | 教师交流：每学年2人；本科生/研究生 每学期2人，免学费 |
| 22 | 台湾中华医事科技大学 | 校级合作协议 | 产学交流 |
| 23 | 新竹交通大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期10人，免学费 |
| 24 | 新竹清华大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 25 | 阳明大学 | 校级合作协议 | 学术交流 |
| 26 | 义守大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期10人，免学费 |
| 义联集团大陆关系企业实习，每学年10人，可申请奖学金 |
| 27 | 元智大学 | 校级合作协议 | 学术交流 |
| 28 | 云林科技大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期3人，免学费 |
| 29 | 政治大学 | 校级合作协议 | 教师交流 每学年3人，提供住宿本科生/研究生 每学期3人，免学费 |
| 新闻传播学院：学生交换，每学期2名，免学费 |
| 30 | 中国文化大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期2人，免学费 |
| 31 | 中山大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期5人，免学费 |
| 32 | 中信金融学院 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期10人，免学费 |
| 33 | 中兴大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学期3人，免学费 |
| 34 | 中原大学 | 校级合作协议 | 学术合作 |
| 35 | 中正大学 | 校级合作协议 | 本科生/研究生 每学年8人，免学费 |
| 香港地区合作院校（8所） |
| 序号 | 院校 | 合作信息 | 学生/教师交换 |
| 1 | 香港大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学期5人，免学费 |
| 2 | 香港中文大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学期5人，免学费 |
| 3 | 香港城市大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学年4人，免学费 |
| 博士生联合培养，每学年10人 |
| 4 | 香港科技大学 | 校级合作协议 | 本科生每学期5人，免学费 |
| 本科生硕士生联合培养，学费12万 |
| 5 | 香港理工大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学期4人，免学费 |
| 6 | 香港教育大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学年3人，免学费 |
| 7 | 香港浸会大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学期5人，免学费 |
| 8 | 香港岭南大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学期5人，免学费 |
| 澳门地区合作院校（2所） |
| 1 | 澳门大学 | 校级合作协议 | 本科生 每学年5人，免学费 |
| 2 | 澳门科技大学 | 校级合作协议 | 学术交流 |
